Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
USP20Q9Y2K6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms