Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP18Q9UMW8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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