Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

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Length 1,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
USP25Q9UHP3 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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