Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CNTNAP2Q9UHC6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms