Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KDM5BQ9UGL1 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms