Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DKK3Q9UBP4 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DKK3Q9UBP4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms