Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PPARGC1AQ9UBK2 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms