Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCDC88CQ9P219 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCDC88CQ9P219 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms