Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TIMMDC1Q9NPL8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms