Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C11orf49Q9H6J7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms