Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KLHL4Q9C0H6 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms