Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM4Q9C037 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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