Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM8Q9BZR9 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms