Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GSDMCQ9BYG8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms