Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HDAC8Q9BY41 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HDAC8Q9BY41 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms