Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPATA16Q9BXB7 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPATA16Q9BXB7 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms