Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SALL3Q9BXA9 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms