Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX3

TMEM208, Transmembrane protein 208, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM208Q9BTX3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
TMEM208Q9BTX3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms