Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MCMBPQ9BTE3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
MCMBPQ9BTE3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms