Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSK4

FEM1A, Protein fem-1 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEM1AQ9BSK4 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FEM1AQ9BSK4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms