Protein–RNA interactions for Protein: Q99607

ELF4, ETS-related transcription factor Elf-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELF4Q99607 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ELF4Q99607 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms