Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
C9orf85Q96MD7 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms