Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLMNQ96JQ2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms