Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
BORCS6Q96GS4 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms