Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RSPRY1Q96DX4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPRY1Q96DX4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPRY1Q96DX4 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPRY1Q96DX4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPRY1Q96DX4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RSPRY1Q96DX4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms