Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG2BQ96BY7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms