Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CAVIN3Q969G5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms