Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CSNK2A3Q8NEV1 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CSNK2A3Q8NEV1 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms