Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TREML1Q86YW5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TREML1Q86YW5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms