Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VITQ6UXI7 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VITQ6UXI7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms