Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TRAF7Q6Q0C0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TRAF7Q6Q0C0 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms