Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TRNP1Q6NT89 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms