Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATG16L1Q676U5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms