Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LDLRAP1Q5SW96 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms