Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ODF2Q5BJF6 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms