Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PDLIM3Q53GG5 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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