Protein–RNA interactions for Protein: Q53EV4

LRRC23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC23Q53EV4 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LRRC23Q53EV4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRRC23Q53EV4 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms