Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
NBPF8Q3BBV2 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NBPF8Q3BBV2 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms