Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
DDR2Q16832 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms