Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RTN1Q16799 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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