Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CA9Q16790 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CA9Q16790 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms