Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SNAPC1Q16533 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SNAPC1Q16533 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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