Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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