Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VPS72Q15906 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
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