Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NCOA1Q15788 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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NCOA1Q15788 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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NCOA1Q15788 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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NCOA1Q15788 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
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NCOA1Q15788 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
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NCOA1Q15788 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NCOA1Q15788 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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