Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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EFNB3Q15768 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
EFNB3Q15768 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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EFNB3Q15768 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
EFNB3Q15768 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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