Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SS18Q15532 SEC14L5-201ENST00000251170 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms