Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

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Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
UBE3CQ15386 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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