Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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EEA1Q15075 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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EEA1Q15075 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
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EEA1Q15075 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
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EEA1Q15075 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
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EEA1Q15075 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EEA1Q15075 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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