Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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BRD3Q15059 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
BRD3Q15059 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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